Ia dahulunya termasuk rusa broket merah Amerika Tengah (M. temama) dan kadangkala rusa broket coklat Yucata (M. pandora) sebagai subspesies.[2] Kekeliruan taksonomi yang besar masih wujud dalam populasi yang tinggal dalam broket merah. Sementara menunggu penyelesaian untuk perkara ini, ia telah dinilai sebagai kekurangan data oleh IUCN,[1] walaupun seperti yang ditakrifkan sekarang, ia merupakan spesies rusa broket yang paling meluas. Ia simpatrik dengan rusa broket coklat Amazon yang lebih kecil dalam kebanyakan taburannya (yang terakhir cenderung mempunyai kepadatan populasi yang jauh lebih rendah). Kariotip broket merah pada mulanya digambarkan mempunyai 2n = 68, FN = 74, dan baru-baru ini mempunyai 2n yang berbeza dari 48 hingga 54 dan FN berbeza dari 54 hingga 56.[1] Kebolehubahan ini mungkin menunjukkan kehadiran spesies yang tidak dikenali dalam populasi.[1]